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31路[下行]： 建康路 -- 白下路·大中桥 -- 太平南路·白下路 -- 太平南路·常府街 -- 杨公井 -- 南京图书馆 -- 大行宫北 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 北京东路·进香河路 -- 北京东路·鼓楼 -- 中山北路·鼓楼 -- 中山北路·大方巷 -- 山西路 -- 中山北路·虹桥 -- 中山北路·三牌楼 -- 中山北路·萨家湾 -- 南医大二附院东院 -- 盐仓桥广场西 -- 中山码头

80路[上行]： 富贵山总站 -- 后宰门 -- 马标 -- 珠江路·小营 -- 浮桥 -- 大行宫北 -- 南京图书馆 -- 大行宫南 -- 杨公井 -- 太平南路·常府街 -- 小火瓦巷 -- 内桥 -- 张府园 -- 建邺路 -- 建邺路·止马营 -- 虎踞南路·水西门 -- 凤台路·水西门 -- 集庆门大桥西 -- 南湖集贸市场 -- 东升村 -- 集庆门大街·南湖路 -- 集庆门大街·湖西街 -- 白鹭花园 -- 集庆门大街·江东中路 -- 福园街

Y1路[上行]： 南京站·南广场西 -- 龙蟠路·南京站西 -- 中央门东 -- 中央门南 -- 许府巷 -- 玄武湖隧道 -- 玄武湖公园 -- 玄武门地铁站南 -- 中央路·鼓楼 -- 鼓楼医院 -- 中山路·珠江路北 -- 中山路·珠江路南 -- 新街口东 -- 大行宫西 -- 杨公井 -- 太平南路·常府街 -- 太平南路·白下路 -- 太平南路·夫子庙

Y1路[下行]： 夫子庙总站 -- 太平南路·白下路 -- 太平南路·常府街 -- 杨公井 -- 大行宫南 -- 新街口东 -- 新街口北 -- 中山路·珠江路南 -- 中山路·珠江路北 -- 鼓楼医院 -- 中央路·鼓楼 -- 玄武门地铁站南 -- 观音里 -- 玄武湖隧道 -- 中央门立交 -- 中央门东 -- 龙蟠路·南京站西 -- 南京站·南广场西

Y2路[上行]： 幕府创新小镇 -- 幕府东路 -- 晓庄村 -- 南京卫校 -- 晓庄 -- 和燕路·青城路 -- 南砖新村 -- 和燕路·迈皋桥 -- 东井村 -- 红山站 -- 东井亭 -- 安怀村东 -- 安怀村 -- 中央门北 -- 中央门南 -- 许府巷 -- 玄武湖隧道 -- 玄武湖公园 -- 玄武门地铁站南 -- 中央路·鼓楼 -- 北京东路·进香河路 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 四牌楼 -- 大行宫北 -- 南京图书馆 -- 大行宫南 -- 杨公井 -- 太平南路·常府街 -- 太平南路·白下路 -- 太平南路·夫子庙 -- 中华路·瞻园路 -- 中华门城堡 -- 大报恩寺遗址公园 -- 应天大街·雨花路

Y2路[下行]： 应天大街·雨花路 -- 大报恩寺遗址公园 -- 中华门城堡 -- 中华路·长乐路 -- 中华路·瞻园路 -- 太平南路·夫子庙 -- 四象桥 -- 太平南路·白下路 -- 太平南路·常府街 -- 杨公井 -- 大行宫南 -- 南京图书馆 -- 大行宫北 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 市口腔医院 -- 玄武门地铁站南 -- 观音里 -- 玄武湖隧道 -- 中央门南 -- 中央门北 -- 安怀村 -- 安怀村东 -- 东井亭 -- 红山站 -- 东井村 -- 和燕路·迈皋桥 -- 迈皋桥地铁站西 -- 南砖新村 -- 和燕路·青城路 -- 晓庄 -- 南京卫校 -- 晓庄村 -- 幕府东路 -- 水吉路南 -- 幕府创新小镇

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